El nexo agua-energía-alimentos (WEF) constituye un aspecto fundamental de la protección ecológica regional y del desarrollo de alta calidad. La aplicación de múltiples políticas relacionadas con el WEF generaría tanto sinergias como compensaciones dentro del nexo WEF. Sin embargo, actualmente falta un marco cuantificado que integre el impacto de múltiples políticas relacionadas con el WEF con las evaluaciones y simulaciones convencionales del nexo WEF. Este estudio cuantificó el nexo WEF en la cuenca del río Amarillo (YRB) de China bajo la influencia de múltiples políticas, calculó las puntuaciones actuales y futuras del WEF bajo diferentes escenarios de combinación de políticas utilizando el método de peso de entropía mejorado, el modelo autorregresivo integrado de media móvil (ARIMA) y el método de optimización lineal. Los resultados revelaron lo siguiente: (1) Desde 2000 hasta 2020, las puntuaciones generales del WEF y las puntuaciones de los subsistemas aumentaron sustancialmente con heterogeneidad espacial. (2) El análisis de escenarios indicó que la implementación de políticas aceleraría generalmente las mejoras en las puntuaciones del WEF en cada ciudad, sin embargo, adoptar todas las políticas simultáneamente no era óptimo para cada ciudad. (3) También se encontró heterogeneidad espacial en los impactos de las políticas en la YRB, con mayores compensaciones en los tramos superiores de las ciudades y mayores sinergias en los tramos medio y bajo de las ciudades. Para alcanzar un desarrollo de alta calidad dentro de la YRB, la implementación de las políticas relacionadas debe considerar las disparidades regionales y mejorar la optimización de la asignación de recursos entre las regiones.